济生肾气丸和金匮肾气丸的区别在于药物成分略有不同，造成功效也有所不同。济生肾气丸的组成主要是熟地、山药、山茱萸、茯苓、泽泻、丹皮，还有牛膝和车前子等，多用于阳虚水泛，在温补肾阳的同时，增加了利水的功效。可用于腰膝酸软，水肿比较厉害的病症。金匮肾气丸的组成是熟地、山药、山茱萸、茯苓、泽泻、丹皮、附子和肉桂，主要可以温阳，温肾阳，可用于肾阳虚的症状，比如腰膝酸软、下肢水肿等等。