萎缩性胃炎的药物治疗方案如下：1、保护黏膜类药物：如硫糖铝；2、复合维生素：如维生素E、猴菇菌片；3、改善贫血类药物：如甲钴胺、叶酸；4、中成药：如摩罗丹、胃复春等，属于常用的经典中成类药物；5、中药方剂：根据自身情况，针对性服用中药方剂，也有一定的治疗效果。