牙周炎治疗的药物大体分为局部用药以及全身用药，牙周炎没有特殊的药物，仅仅是一个辅助作用。全身的用药主要是指一些抗生素包括青霉素类的，如阿莫西林、青霉素V钾等，硝基咪唑类，甲硝唑或替硝唑或奥硝挫等，而硝基咪唑类的药物和青霉素类联合服用对于一些较重牙的周炎症可以起到更好的疗效。局部的药物包括含漱类药物，如氯己定类、双氧水等。对于局部牙周袋的药物主要是一些局部消炎、收敛防腐的药物。