治疗小孩消化不良的药物有很多种，例如乳酸菌的药物、益生菌、婴儿健脾散、复方胃蛋白酶散，都可以起到帮助消化的效果。但是服用任何药物都必须听从专业医生指导服用。家长不要自行给宝宝服用任何药物，如果宝宝表现出食欲不佳，大便异常的时候，需要去医院检查一下。治疗期间应尽量给宝宝吃清淡易消化的食物，还要注意腹部保暖。