根治脚气的最佳方法应当是采取综合治疗，首先需要注意穿透气好的鞋子，因为真菌在潮湿的环境中更容易生长，保持局部清洁干燥卫生可以在一定限度上限制真菌的生长。其次需要在医生指导下给予抗真菌治疗措施，具体需要根据脚气的类型，比如疱疹性，角质性或者糜烂性，可以采取不同的办法。最后如果局部使用药物治疗效果不佳，可以同时口服抗真菌的药物，疗程不宜太短。