国家将新生儿甲减列入新生儿筛查的疾病后，使本病的早发现率明显提升，预后大为改善。新生儿筛查阳性者确诊后即开始正规治疗预后良好。如生后3月内开始治疗预后尚可，智能绝大部分可达到正常。如未能及早诊断而在6个月后才发现开始治疗，虽可改善生长状况，但是智能仍可受到严重损害。