指甲长肌肉里面可以采取清洗消毒治疗，然后使用消炎药治疗，要定期的剪指甲，而且不要穿太紧的鞋子，要注意脚部的卫生。如果病情严重，可以考虑采取拔甲治疗，指甲长肉里多见于甲沟炎，和指甲生长异常有关系，也可能是受到挤压，造成表现出长脓。