手术切除腱鞘囊种的时候，主要是进行局部的麻醉，如果囊肿非常大的话，还可以进行神经阻滞麻醉，然后把腱鞘囊肿完整的摘除，如果腱鞘囊肿和关节囊有连接的话，需要把出口的部位相互结扎，避免再次复发腱鞘囊肿，手术之后，要保持手术切口的清洁干燥，并且加强换药，防止伤口的感染，同时，术后短期内应该避免手腕的过度活动，否则有可能会再次复发腱鞘囊肿。