慢性直肠炎可以用药物或者手术治疗。对于一般病人，可以经直肠给药，局部应用美沙拉嗪联合糖皮质激素保留灌肠法，可有效缓解溃疡性直肠炎。病人需要注意保持肛门周围皮肤的清洁和干燥，便后用温水清洗，或用1:5000的高锰酸钾坐浴，坐浴15-30分钟，每日1-2次。手术治疗可以采用全结直肠切除回肠储袋肛管吻合术，病人大多预后良好，不易复发。