怀孕三个月肚子表现出隐隐作痛的原因是要分情况来判断，若只是单纯的作痛情况考虑是因为不规律宫缩造成的，如果是表现出隐隐作痛的同时有时阴道少量出血等表现出则考虑是因为先兆流产造成的。表现出这种症状建议先注意观察，尽可能的卧床休息，防止过于劳累，保持乐观的情绪，其次要积极观察自身情况，如果是阴道有少量出血等表现表现出，建议及时到医院进行相关检查来排除流产的现象进行治疗。