幽门螺旋杆菌感染的患者，需要应用抗生素杀灭此菌，可以选择大环内酯类的抗生素治疗，也可以选择半合成青霉素类的抗生素治疗。需要应用抑制胃酸的药物，可以用质子泵抑制剂，或者H2受体拮抗剂，减少胃酸的生成，可以破坏幽门螺旋杆菌的环境，需要应用保护胃黏膜的药物，应用益生菌治疗等。