巧克力囊肿是卵巢囊肿的一种，属于子宫内膜异位症的范畴，是一种病理性的卵巢囊肿，是不会自己消失的。而且还有随着月经的来潮，子宫内膜的脱落，有逐渐增长的趋势，严重的可以造成痛经，月经不规律。如果较小的卵巢囊肿可以用药保守治疗，抑制囊肿的生长，可以使囊肿逐渐缩小，严重的需要手术治疗，进行卵巢囊肿剥离才可以痊愈。