子宫颈腺囊肿，一般是不会影响怀孕的。子宫颈腺囊肿通常情况下也不需要处理。但是深部的子宫颈腺囊肿，子宫颈表面无异常，表现为子宫颈肥大，要注意与子宫颈腺癌相鉴别，必要的时候要进行子宫颈管搔刮术。子宫颈腺囊肿，绝大多数情况下是子宫颈的生理性变化。子宫颈转化区的鳞状上皮取代柱状上皮过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口或者伸入腺管内，将腺管口堵塞，导致腺体分泌物引流受阻，潴留而形成囊肿。子宫颈局部损伤或者子宫颈慢性炎症，使腺管口狭窄，也可以导致子宫颈腺囊肿形成。