宝宝乳糖不耐受的常见表现为腹胀，肠鸣音亢进，肠绞痛，出现恶心，呕吐等胃肠道症状，部分患儿肠道运动减弱出现便秘，症状严重程度与进食乳乳制品的量有关。因此也有少部分患儿进食可耐受的一定量乳制品不会出现明显症状，具体可耐受的量因人而异。婴幼儿乳糖不耐受常见症状还有腹泻，典型的粪便为黄色稀水样便或者蛋花汤样便带泡沫以及酸臭味，有奶块，少数患儿有回奶或呕吐。患儿还伴有腹胀和不同程度的哭闹不安，排便或经治疗后腹泻好转。