子宫内膜组织出目前子宫体以外的部位时，成为子宫内膜异位症。异位的内膜可以侵犯全身任何部位，但绝大部分位于盆腔脏器和腹膜，以卵巢、宫骶韧带最多见。 异位子宫内膜来源至今尚未明确，没有单一的理论可以解释内异症的发生，现阶段普遍接受的是子宫内膜种植学说，此外可能和机体的免疫功能、遗传因素、环境因素有关。此外某些因素会增加子宫内膜异位症的患病风险，如体内雌激素水平高、生殖道发育异常、患有自身免疫性疾病等。