造成女性腰窝痛的原因很多，既可能是腰椎的问题，也可能是其他疾病和激素变化造成的。造成腰窝疼痛的主要原因如下：1、腰三横突综合征：腰窝对应腰三椎体的横突，是腰部肌肉的支点，可能在受牵拉或着凉的情况下表现出腰部疼痛，腰肌筋膜炎也可以造成腰窝疼；2、腰间盘突出：腰窝部恰巧是腰间盘突出的疼痛点，腰间盘突出会造成局部的神经根受牵拉或刺激，引发神经根支配区的疼痛，表现出典型的腰痛并带有下肢疼痛，腰部按压痛点之后可以表现出向腿部的放射。建议到医院就诊，进行核磁共振检查以明确诊断；3、特殊疾病：肌皮硬化症等疾病，也会造成腰窝疼痛；4、月经来潮：女性月经来潮前期，由于肾上腺素的作用会造成腰窝处疼痛。