奥硝唑和甲硝唑最主要的区别有以下几点：第一点，奥硝唑属于第三代硝基咪唑类药物，甲硝唑属于第一代硝基咪唑类药物。第二点，奥硝唑血浆消除半衰期为14小时，所以相对甲硝唑来讲，前者一天内用药次数一般少于后者用药次数。第三点，甲硝唑药品说明书明确指出，防止饮酒或者含有酒精的饮料，而奥硝唑药品说明书指出，这种药物不会抑制乙醛脱氢酶。值得提及，虽然奥硝唑不影响酒精代谢，但是强烈建议，用药后不要饮酒。