复杂性肾囊肿是有可能会癌变的。肾囊肿属于泌尿外科常见病和多发病，对于单纯性肾囊肿，绝大多数都属于良性疾病，但是如果囊肿有分隔或者多囊，这种情况下称之为复杂性肾囊肿，复杂性肾囊肿，有一部分是为囊性肾癌，建议通过强化核磁共振等相关检查来进一步明确诊断。如果有不均匀质强化，应该高度怀疑为恶性囊肿。针对这种情况，如果囊肿体积偏小，那么可以通过肾部分切除方式来进行及时治疗及处理；如果囊肿体积偏大，往往侵犯到正常的肾实质，就需要通过根治性肾切除等方式来进行治疗。手术之后通过病理检查可以判断是良性还是恶性。如果是单纯的肾囊肿，即便是良性病变，对于大于4公分以上的，往往还是需要通过肾囊肿去顶减压手术等方式来进行及时的治疗。