咽峡炎和扁桃体炎，主要是临床医学根据疾病的不同病理改变和解剖部位而分的两种病，但实际上两者常常同时存在，而且互相影响。一般来讲，若是以软腭、悬雍垂以及左右两侧腭舌弓、腭咽弓的黏膜病变为主称作为咽峡炎，如果以扁桃体的黏膜、扁桃体隐窝为主的病变这个是扁桃体炎。实际上咽峡炎和扁桃体炎检查两者是有区别的。咽峡炎局部，除了咽峡黏膜的充血外，会表现出局部滤泡的表现。而扁桃体发炎，扁桃体明显充血、肿大，扁桃体表面有脓性分泌物、黄白色的片状物，没有疱疹。