同房时肚子疼的原因有很多，首先要考虑到生理性原因，是由于同房时动作过于剧烈，子宫不规则收缩造成，再者要考虑到病理性原因，比如有盆腔炎，附件炎，子宫内膜炎，具体原因需要到医院检查。女性容易受妇科疾病困扰，女性平常一定要加强对自己的照顾，比如平常要注意保暖，不能着凉，经期不可以有性生活等。