病因不是很清楚，目前认为和遗传因素、?激素、环境因素、药物、感染，内分泌等因素有关。第一遗传因素，红斑狼疮的发病有家族的聚集倾向，0。4%～0。5%的系统性红斑狼疮患者的一级或者二级亲属患狼疮或者其他自身免疫疾病，红斑狼疮的发生跟种族也有关系，西方的黑人发病率是白人的三倍，在北美印第安人中明显增高。这些都提示，系统性红斑狼疮的发病与遗传因素相关；第二雌激素，红斑狼疮的发病女性明显多于男性，发病多见于育龄期的女性，妊娠可以诱发或加重红斑狼疮，因此红斑狼疮发病与雌激素相关；第三环境因素，比如紫外线照射，可以激发或者加重红斑狼疮。还比如一些药物，肼苯哒嗪、异烟肼和青霉素等均可诱发药物性狼疮；某些感染，比如EB病毒或链球菌感染，可以诱发或加重本病。