反应性关节炎的发病和感染、遗传标记（HLA-B27）和免疫失调有关。病人亲属中骶髂关节炎、强直性脊柱炎和银屑病发病数均高于正常人群。造成反应性关节炎的多见病原微生物包括肠道、泌尿生殖道、咽部及呼吸道感染菌群，甚至病毒、衣原体及原虫等。这些微生物大部分为革兰染色阴性，具有粘附黏膜表面侵入宿主细胞的特性。