双侧卵巢囊肿如何进行调理，主要还是需要看卵巢囊肿的大小以及性质。1、生理性的卵巢囊肿，比如黄体囊肿，这种情况下是不需要进行治疗的，可以在月经干净后三天做B超复查，消失属于正常。2、检查发现双侧卵巢属于巧克力囊肿，并且伴有痛经的症状，此时最好还是以药物治疗为主，比如桂枝茯苓丸。但是，如果巧克力囊肿超过五厘米以上，一般情况下建议手术治疗。3、只是一般的卵巢囊肿，并且比较小，也可以不用治疗观察，做好复查即可。