原发性肝癌最主要的转移部位是肝内转移，其发生的原因主要是癌细胞可以通过肝内门静脉系统或者肝静脉系统进行播散，这也是造成原发性肝癌容易出现术后复发的原因之一。而原发性肝癌还有可能出现肝外转移，比如肺转移、骨转移以及脑转移等。其中以肺转移最多见，主要是由于肝内门静脉和肝静脉通过肝血窦相连，肝静脉最终汇入肝后下腔静脉，将血液运输至心脏和肺，也是造成肺转移最主要的原因之一。不过即使原发性肝癌出现肝内转移，如果直径较小、数目较少而且发生的较为局限，也可以考虑进行根治性的手术切除，以获得较好的生存期。即使无法进行手术切除，也可以通过介入栓塞或者射频消融的方法达到延长生存期的目的。而原发性肝癌术后的患者也应当考虑经肝动脉化疗，可以进一步杀灭肝内可能存在的癌细胞，以减少肝内转移和复发。