卵巢囊肿的危害包括卵巢囊肿容易扭曲血管，阻断血液供应，因此造成器官坏死；卵巢囊肿容易破裂，造成腹腔污染、炎症、腹痛、发热等表现。卵巢囊肿会造成并发感染。卵巢囊肿可能造成女性不孕或异位妊娠。良性卵巢囊肿有癌变的可能。如果囊肿造成输卵管扭转或扭曲，也可能影响妊娠，甚至造成异位妊娠等。