前列腺囊肿的发生有先天性囊肿和后天性囊肿两种。先天性囊肿就是前列腺先天性发育不良，常伴随隐睾、肾发育不完善等疾病；后天囊肿一般都是炎症囊肿，是由慢性前列腺炎所造成的一些组织增生，或是前列腺分泌物滞留所造成的囊肿。