现阶段克罗恩病的致病原因并不是特别明确，造成这种疾病发生的因素有很多，主要是在因素的相互作用下而产生基本病因，包括了环境因素，遗传因素以及感染和菌群因素等存在，同时也存在一部分免疫方面的因素，容易造成这类疾病发生。