克罗恩病和溃疡性结肠炎目前的发病原因、病理机制还不是非常明确，可能和自身免疫系统功能紊乱有关系。这两个病是有区别的，首先这两个病的发病部位不同，临床表现不太一样，克罗恩病容易发生在回肠末端，溃疡性结肠炎往往侵犯远端结肠，特别是乙状结肠部位，另外侵犯直肠。在临床表现上克罗恩病往往是慢性腹泻，右下腹隐约的疼痛，溃疡性结肠炎患者主要是左下腹部的疼痛，在发作期伴有脓血样的大便，里急后重的特点。其次，在进行肠镜检查时，二者的表现也不一样，克罗恩病出现鹅卵石样改变，溃疡性结肠炎肠黏膜出现颗粒状改变。