一般在超声检查存在异常的情况，可行胎儿核磁共振进一步的确诊。胎儿核磁共振在在产科的应用越来越多，主要的临床检查包括以下方面：胎儿中枢神经系统，如脑积水、脑肿瘤、侧脑室明显增宽等；胎儿颜面部，如唇裂、腭裂等；胸腹部肿瘤病变；泌尿系统，如异位肾、多囊性发育不良肾；胃肠道系统，如肛门闭锁、先天性十二指肠闭锁等；四肢脊柱发育情况，如肢体缺如或发育不良，脊柱裂等。