一般情况肠镜是否疼痛和以下几个因素有关：病人的肠道准备工作。如病人肠道准备不充分，大量粪便潴留，视野不清楚，会影响观察及进镜，也会带来比较大的痛苦。病人的自身情况，如果病人有过腹部手术史，正常会有肠道的黏连和肠道的走行异常，也会给进镜带来困难，造成腹痛不适。还有一个是术者的操作水平，正常病人痛苦是因为乙状结肠及横结肠结攀导致的，强行带攀进镜会给病人带来巨大的痛苦，如果术者操作例数多，经验丰富，善于在乙状结肠及横结肠解攀，达到无攀进镜，那么会大大较少病人的痛苦。同样经验丰富的术者会少注气，这样病人腹痛腹胀的症状明显减少。