做肠镜检查，主要可以检查出包括回肠末段，盲肠，升结肠，降结肠，横结肠，乙状结肠，直肠段的炎症，溃疡，出血，肿瘤等疾病。肿瘤包括有良性肿瘤和恶性肿瘤，多见的良性肿瘤，包括肠息肉。恶性肿瘤，包括结肠癌，间质瘤，神经内分泌肿瘤，淋巴瘤等。并可以在肠镜下做息肉钳除术或者是息肉电凝切除术治疗。对怀疑有恶性肿瘤的病人，可以采取肿物组织活检做病理诊断，明确诊断。对一些出血性的疾病可以在内镜下做治疗，可以对止血部位进行喷洒止血，或者是电凝止血，或者是用止血夹夹闭止血，或者是打硬化剂、组织胶等方式进行镜下止血。对一些功能性的胃肠道疾病，必须要经过肠镜检查排除器质性疾病之后才能得出功能性肠病的诊断。