低氯症的治疗以病因治疗为主，去除消化道疾病造成的恶心呕吐，肾炎或肾功能减退者，防止大量使用利尿剂，大量出汗时补充盐水。用于肾上腺皮质功能减退等。并发低钠血症时，可用浓氯化钠注射液或口服盐胶囊进行补钠治疗。每天检查电解质，评估疗效，一般经过以上治疗即可治愈，部分低氯症病人可伴随肺部肿瘤分泌异常激素水平。