出现肛门湿疣的患者可以在医生指导下进行二氧化碳激光治疗、冷冻治疗、电灼治疗、微波治疗、β-射线治疗等等。如果患者的湿疣面积较小且是单发性的，可以直接进行手术切除治疗。如果患者的湿疣比较大，属于巨大湿疣，则可以进行Mohs氏手术切除，在手术过程中，可以应用冷冻切片检查损害明确是否已经切除干净。出现肛门湿疣的患者平时应尽量保持饮食清淡，保持肛门周围清洁。