婚后三年不孕的原因有很多，可能是男性精子异常造成的，如男性少精症、弱精症、无精症等，或是女性输卵管堵塞、输卵管炎、空卵泡综合征等因素造成的。如果女性本身肥胖、长期生活方式不良或是患有内分泌疾病等，也会导致不孕。