生殖器疱疹的发病部位集中于生殖器官、尿道口、大腿和臂部等处。而湿疹在全身各处都有可能会出现。湿疹虽然会反复瘙痒但只局限于同一部位。生殖器疱疹的患者会出现小水疱，然后破溃化脓结痂，而湿疹无水疱，无脓，瘙痒的部位就会发红突起。