西医药物治疗是手术治疗的辅助治疗方法，一般讲究对症应变，如血尿、并发症感染，一般应用相应抗生素;高血压口服降压药物;肌酐、尿素氮高服用降低肌酐尿素氮的药物等。这种双肾囊肿治疗方法短期见效快，但从长远看极大可能导致病不胜症，后期恶化更甚。。