心理咨询师证书的颁发部门在中国主要是人力资源和社会保障部（原劳动和社会保障部）以及中国心理卫生协会，这两个机构对中国的心理咨询行业有着重要的影响和指导作用。

人力资源和社会保障部是中国负责全国人力资源和社会保障工作的最高行政管理部门，它制定并实施国家的职业技能鉴定政策，包括心理咨询师的职业资格认证工作，通过职业技能鉴定考试，达到相应标准的考生，将由人力资源和社会保障部颁发心理咨询师职业资格证书，这个证书是证明持证人具备专业心理咨询能力的重要凭证，在就业、晋升等方面具有法律效力。

中国心理卫生协会则是我国心理学界的权威学术团体，其在心理咨询领域的专业指导和规范作用不容忽视，虽然它并不直接颁发心理咨询师证书，但其组织的心理咨询师专业培训课程和认证项目，被业界广泛认可，获得该协会认证的心理咨询师，通常被视为具有较高专业水准的象征。

心理咨询师证书的颁发主要涉及政府行政部门与专业学术团体的合作，以确保心理咨询行业的规范化和专业化发展，持证人在接受持续教育和专业实践的过程中，也需要不断更新知识，提升技能，以适应社会需求和行业发展。